2010年，卓凱（苗僑偉飾）神秘前往泰國曼谷，與潛伏在當地的香港CIB臥底進行打擊泰國毒梟的行動。就在眾人完成任務即將撤離泰國之時，一場爆炸令卓凱手下臥底全部葬身火海。 與此同時，卓凱好友兼CIB督察黎瑞權（張兆輝飾）原因不明地被殺害，留下一個還未正式成為臥底的女警鄭淑梅（黃翠如飾）由卓凱接手指導。卓凱知道瑞權手下還有其他身份被刪除的臥底，要還原瑞權之死的真相，必須將臥底全部找出來，卓凱與淑梅開始尋找臥底的工作。另一方面，“長興”坐館魏德信（陳豪飾）打算重建幫會，對字頭里的叔父輩趕盡殺絕，覃歡喜（許紹雄飾）雖逃過一劫，愛妻卻死在他懷抱中。事后歡喜潛入警署，刪除自己的臥底檔案，徹徹底底地淪為黑道中人并成立新字頭“福和”，誓要與德信拼個你死我活。 卓凱和淑梅陸續確認了樂少鋒（周柏豪飾）和徐天堂（袁偉豪飾）的臥底身份。為了盡快尋回其他臥底，卓凱更親自潛入長興，遇到專門替德信處理黑錢生意的施嘉莉（宣萱飾），從而更深入發現犯罪世界的另一面。歡喜與德信的斗爭，將卓凱和眾臥底卷入其中，為對付德信以及他操控的黑警勢力，卓凱及眾臥底不得不與歡喜聯手。旺角警署PC警員陸SIR（陳嘉俊飾）發現警隊接連發生高層警官被殺事件。卓凱及淑梅同時發現，這一切可能是少鋒所為，少鋒身份就被德信發現，落得慘死收場……長興與福和斗爭白熱化，雙方牽涉入一宗國際犯罪集團的洗黑錢活動當中，德信使計令歡喜一敗涂地，但同時他所有黑錢一夜之間不翼而飛。各地犯罪集團首腦紛紛來港向德信問責。卓凱布下天羅地網，準備把各地犯罪首腦一網打盡。德信拼死反撲，卓凱、淑梅、歡喜、天堂等都被列入“必殺”名單，到底他們最后能否逃過一劫？
